土木工程学院是在原衡阳矿冶工程学院水冶系的基础上发展起来的，是南华大学办学历史较长、师资力量雄厚、规模较大和办学实力较强的学院之一。学院现有土木工程（含建筑工程、岩土工程、工程造价3个方向）、建筑环境与能源应用工程、给排水科学与工程、建筑电气与智能化及道路桥梁与渡河工程5个专业。
1958年，衡阳矿冶工程学院设水冶系、采矿工程系
1983年，衡阳工学院设建筑工程系
2000年，中南工学院与衡阳医学院合并组建南华大学，设建筑工程与资源环境学院
2002年，原核工业六所的采矿室、溶浸室、环保室和设计所合并入建筑工程与资源环境学院
2006年，环境工程、安全工程、建筑学等专业陆续从学院分离，学院更名为城市建设学院
2016年，学院更名为土木工程学院
